Si instalamos windows despues de tener linux instalado en una partición libre hay que reinstalar el grub para poder elegir el sistema que queremos que arranque.

Partiendo del siquiente sistema de archivos:

Dispositivo Tamaño Tipo
/dev/sda1     100M Sistema EFI
/dev/sda2     150G Sistema de ficheros de Linux
/dev/sda3      16M Reservado para Microsoft
/dev/sda4     200G Datos básicos de Microsoft

Pasos

• Arrancar con un Live CD / Usb Live de linux
• Ejecutar los siguentes comandos:

 sudo mount /dev/sda2 /mnt
 sudo mount /dev/sda1 /mnt/boot/efi
 for i in /dev /dev/pts /proc /sys /run; do \
     sudo mount -B $i /mnt$i; \
 done
 sudo chroot /mnt
 grub-install /dev/sda
 update-grub